FS? Mix Direct for Tissue
Cat. #:P2071b,P2072b
產(chǎn)品簡(jiǎn)介
FS??Mix Direct for Tissue是適合組織樣本擴增的2×濃縮快速高效PCR預混合溶液,含有FS? Taq DNA聚合酶、dNTP混合物、緩沖液等PCR擴增必需組分(模板與引物除外)。使用時(shí),僅需在擴增體系中加入簡(jiǎn)單處理后的樣本處理液和引物即可進(jìn)行PCR,從而可以極大地簡(jiǎn)化操作過(guò)程,縮短操作時(shí)間,降低污染(加樣次數減少)。FS??Mix Direct for Tissue的反應體系經(jīng)過(guò)優(yōu)化處理,高靈敏度的FS??Taq DNA聚合酶確保處理液中的微量樣本得到高效擴增。本產(chǎn)品不用進(jìn)行繁瑣的DNA提取,最大限度減少實(shí)驗誤差和交叉污染;同時(shí)依靠特殊的緩沖體系增強PCR擴增的特異性,保證擴增效果與DNA模板擴增效果同樣可靠。
FS??Taq DNA聚合酶是根據蛋白工程原理,以Taq DNA聚合酶為基礎,研發(fā)設計的新一代DNA聚合酶。本產(chǎn)品具有類(lèi)似KOD酶的快速擴增能力,延伸速度為20s/kb(70~75℃,簡(jiǎn)單模板可達5s/kb)。是普通Taq DNA聚合酶的3倍,可縮短一半以上的擴增時(shí)間;同時(shí)具備Taq DNA聚合酶擴增效率高、適應性廣等優(yōu)點(diǎn)。FS??Taq DNA聚合酶使用方法與普通Taq DNA聚合酶基本相同,只需注意適當縮短延伸時(shí)間。該酶具有5'→3'聚合酶活性,無(wú)3'→5'外切酶活性。擴增產(chǎn)物具有3'-dA突出端,可直接用于TA克隆。
產(chǎn)品組成
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Component |
P2071b |
P2072b |
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2× FS??Mix ? Direct for Tissue |
1 ml |
1 ml× 5 |
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超純水 |
1 ml |
1 ml× 5 |
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Neutralization? ? Solution?? |
1 ml |
5 ml |
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Extraction? ? Solution???? |
10 ? ml |
40 ? ml |
本產(chǎn)品分體系中包含溴酚藍、不含溴酚藍兩類(lèi)。體系中包含溴酚藍的產(chǎn)品,PCR擴增產(chǎn)物可直接電泳檢測。這兩類(lèi)產(chǎn)品的擴增性能無(wú)差異。如無(wú)特別說(shuō)明提供體系中包含溴酚藍的包裝。
保存條件
-20℃保存2年。
質(zhì)量控制
純度檢測:經(jīng)質(zhì)量檢測,產(chǎn)品不含脫氧核糖核酸內切酶、脫氧核糖核酸外切酶和核糖核酸酶污染。
功能檢測:PCR方法檢測無(wú)宿主殘余DNA,能有效擴增人基因組中的單拷貝基因。
應用舉例
1.?處理樣品
組織:取3-5mg組織置于1.5ml離心管中,加入180 μl Extraction?Solution,充分渦旋振蕩,95℃溫浴10min。加入20 μl?Neutralization?Solution,充分渦旋振蕩,5,000rpm離心2min,取0.5-2 μl上清進(jìn)行擴增。
頭發(fā):取兩根帶毛囊的頭發(fā),剪下帶毛囊的發(fā)根放入1.5ml離心管中,加入180 μl Extraction?Solution,充分渦旋振蕩,95℃溫浴10min。加入20 μl?Neutralization?Solution,充分渦旋振蕩,5000rpm離心2min,取0.5-2 μl上清進(jìn)行擴增。
口腔拭子:取樣前30min內請勿進(jìn)食及飲水,使用無(wú)菌棉簽在口腔內擦拭10次。將棉球剪下置于1.5ml離心管中,加入180 μl Extraction? Solution,充分渦旋振蕩,95℃溫浴10min。加入20 μl?Neutralization?Solution,充分渦旋振蕩,5,000rpm離心2min,取0.5-2 μl上清進(jìn)行擴增。
培養細胞:如果是懸浮培養細胞直接取1×103-104當量的細胞加入到50 μl?PCR反應體系中即可。如果是貼壁培養細胞,取3-5mg細胞組織置于1.5ml離心管中,加入180 μl Extraction?Solution,充分渦旋振蕩,95℃溫浴10min。加入20 μl?Neutralization?Solution,充分渦旋振蕩,5,000rpm離心2min,取0.5-2 μl上清進(jìn)行擴增。
血液、淋巴液DNA病毒:取100 μl血清或淋巴液至1.5ml離心管中,加入180 μl Extraction?Solution,充分渦旋振蕩,95℃溫浴10min。加入20 μl?Neutralization? Solution,充分渦旋振蕩,12,000rpm離心10min,取0.5-2 μl上清進(jìn)行擴增。
2.?配制反應體系
請于冰上配置反應體系,體系大小與組分用量與添加順序可調整:
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Ordinal |
Component |
Volume (50 μl reaction volume) |
Final ? concentration (50 μl reaction volume) |
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1 |
2× FS??Mix ? Direct for Tissue |
25 ? μl |
1× |
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2 |
upstream ? primer (10 μM)[1] |
2 μl |
0.4 ? μM |
|
3 |
downstream ? primer (10 μM)[1] |
2 μl |
0.4 ? μM |
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4 |
處理液上清 |
0.5-2 ? μl |
<1μg |
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5 |
超純水[2] |
To 50 ? μl |
- |
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optional |
MgCl2(MgSO4)/PCR ? Enhancer[3] |
Variable |
- |
[1]?引物終濃度建議范圍:0.1-1 μM。特異性差時(shí)可降低濃度,效率低時(shí)可提高濃度。
[2]?可單獨訂購超純水(Cat. #:P9021/P9022/P9023)。
[3]?可單獨訂購25mM MgCl2(Cat. #:P9031)和PCR Enhancer(Cat. #:P9041)。
3.?設定反應程序進(jìn)行PCR反應
大多數模板的快速擴增條件:
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Stage ? |
Temperature |
Time |
Number ? of Cycles |
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Initial ? Denaturation |
94℃ |
3 ? min |
1 |
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Denaturation |
94℃ |
30 ? sec |
28-40 ? |
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Annealing |
55-68℃[1] |
30 ? sec |
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Extension |
72℃ |
Variable[2] |
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Final ? Extension |
72℃ |
2 ? min |
1 |
[1]?退火溫度應根據Tm值較低的引物來(lái)設。
[2]?延伸時(shí)間按20 sec/kb來(lái)設最佳。
1kb簡(jiǎn)單模板的快速擴增條件:
由于1kb簡(jiǎn)單模板的二級結構簡(jiǎn)單,且長(cháng)度較短,可同時(shí)縮短變性、退火時(shí)間至15s,延伸時(shí)間20s,以實(shí)現快速擴增。
4.?分析結果
反應產(chǎn)物可直接進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,通過(guò)凝膠成像設備觀(guān)察目的條帶的擴增情況。如有需要,可進(jìn)行割膠回收。無(wú)產(chǎn)物或產(chǎn)物量少的改進(jìn)措施有:1調整退火溫度;2減少抑制劑的影響,如提取的基因組DNA中含有抑制擴增的成分,需要高倍稀釋?zhuān)?: 10000)后使用;3采用乙醇沉降洗脫,提高模板DNA的純度;4使用PCR添加劑,如PCR Enhancer(Cat. #:P9041)、MgCl2(Cat. #:P9031)等可提高產(chǎn)量。
操作注意事項
處理的組織樣本往往不會(huì )完全溶解,這是正?,F象。溶解在處理液中的組織樣本足夠滿(mǎn)足FS??Mix Direct for Tissue擴增的需要。
室溫下FS??Taq DNA聚合酶有一定的活性,為避免發(fā)生非特異性擴增,請于冰上配置反應體系,并且最后添加模板DNA。
延伸時(shí)間視片段長(cháng)度而定。一般情況,≤500bp目的片段延伸15s,500bp-1kb延伸20s,>1kb延伸時(shí)間按20s/kb計算。
FS? Taq DNA聚合酶具有脫氧核苷酸轉移酶活性,因此在PCR產(chǎn)物3’末端通常會(huì )加上一個(gè)多余的脫氧腺嘌呤核苷,可進(jìn)行TA克隆。
FS??Mix Direct for Tissue也可采用常規程序擴增。
引物設計注意事項
引物長(cháng)度一般在15-30個(gè)堿基之間;上下游引物3’末端避免互補,避免出現3個(gè)以上重復的G或C,或出現發(fā)夾結構,否則會(huì )產(chǎn)生非特異性擴增;GC含量控制在40-60%,且上下游引物GC含量盡量接近;Tm值控制在55-65℃之間,且上下游引物Tm值盡量接近,額外附加序列(酶切位點(diǎn)、修飾等)是非模板匹配序列,不參與Tm值計算。
相關(guān)產(chǎn)品
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名稱(chēng) |
貨號 |
規格 |
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PCR Mix |
P2011/P2012/P2013/P2014/P2015 |
1ml/5ml/10ml/50ml/100ml |
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Power Green qPCR Mix |
P2101/P2102/P2103/P2104/P2105 |
1ml/5ml/10ml/50ml/100ml |
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1kb ladder |
M1181/M1182 |
50次/250次 |
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DSTM5000 |
M1111/M1112 |
60次/300次 |
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高純度質(zhì)粒小提試劑盒 |
N1011/N1012/N1013 |
50次/100次/200次 |
|
通用RNA提取試劑盒 |
R1051 |
50次 |
|
基因組DNA快速提取試劑盒 |
N1111/N1112 |
50次/100次 |
|
DNA凝膠回收試劑盒 |
N1071/N1072/N1073 |
50次/100次/200次 |
|
RT-PCR Kit |
R1011/R1012 |
20次/100次 |
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