PCR(聚合酶鏈式反應)幾乎是分子實(shí)驗室里最常見(jiàn)的技術(shù)之一。但有時(shí)候,做著(zhù)做著(zhù),條帶就是不上鏡:要么無(wú)條帶,要么全是拖尾,要么陰性對照還神奇地亮了……??
別急!今天我們就來(lái)盤(pán)點(diǎn) PCR失敗的5個(gè)常見(jiàn)原因,并提供實(shí)用的解決辦法,幫你少踩坑。
1???模板DNA質(zhì)量或濃度不合適
?? 表現:無(wú)條帶、條帶過(guò)弱或拖尾。
????? 原因:DNA降解、雜質(zhì)殘留,或者濃度過(guò)低/過(guò)高。
? 解決辦法:
- 保證DNA純度(A260/A280 = 1.8–2.0);
- 稀釋過(guò)濃模板;
- 植物/土壤等樣本建議用高純度提取試劑盒。
2???引物設計或濃度有問(wèn)題
???表現:非特異性條帶、引物二聚體。

???原因:引物設計不合理,濃度過(guò)高/過(guò)低。
??解決辦法:
-
長(cháng)度18–25 bp,GC含量40–60%;
-
避免3’端互補;
-
終濃度一般0.1–0.5 μM,必要時(shí)做梯度PCR優(yōu)化。
3???PCR體系或酶活性問(wèn)題
???表現:完全無(wú)擴增或擴增效率低。

???原因:Taq酶失活、Mg2?濃度不合適、dNTP降解。
??解決辦法:
-
分裝保存酶,避免反復凍融;
-
優(yōu)化Mg2?濃度(1.5–2.5 mM);
-
用新鮮dNTP;
-
推薦選擇性能優(yōu)異的PCR預混液??? 預混液中已優(yōu)化了緩沖體系和酶活性,能顯著(zhù)提升擴增成功率,減少反復調試的時(shí)間,非常適合常規科研實(shí)驗。
4???實(shí)驗操作污染
???表現:陰性對照也出現條帶。

???原因:PCR產(chǎn)物殘留、移液槍污染、空氣中DNA污染。
??解決辦法:
-
嚴格分區操作(提取區/體系配置區/產(chǎn)物分析區分開(kāi));
-
用帶濾芯的槍頭;
-
定期清潔實(shí)驗臺,使用核酸去除劑。
5???循環(huán)條件設置不當
???表現:條帶模糊、非特異性擴增或無(wú)結果。

???原因:退火溫度過(guò)低/過(guò)高、延伸時(shí)間不足、循環(huán)數過(guò)多。
??解決辦法:
-
根據引物Tm值設置退火溫度;
-
延伸時(shí)間約 1 kb/min;
-
循環(huán)數控制在30–35次。
???總結
PCR失敗并不可怕,常見(jiàn)問(wèn)題主要集中在?模板、引物、體系、操作和循環(huán)條件?這五個(gè)方面。逐一排查,總能找到原因。
而對于高校實(shí)驗室或科研人員來(lái)說(shuō),選擇一款高性能PCR預混液,往往能讓PCR事半功倍,節省大量試錯時(shí)間。
?? 科研路上,少一點(diǎn)彎路,多一點(diǎn)高效!
| 貨號 | 產(chǎn)品名稱(chēng) | 適用場(chǎng)景 |
| P2141 | Super TaqMix | 常規PCR擴增 |
| P2111 | Super HIFI PCR Master Mix | 長(cháng)片段高保真擴增 |
| P2121 |
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| P2091 | SYBR Green qPCR Mix | 染料法高特異性基因定量分析 |
| P2701 | Multiplex Probe qPCR Mix Plus U | 探針?lè )ǘ嗷蛲瑫r(shí)定量檢測 |
| R1081 | PowerScript RT SuperMix | 全預混高效RNA逆轉錄 |
| RP1001B | 2X One Step RT-PCR Mix | 快速逆轉錄與PCR擴增一體化 |
| V5007 | 2X One Step Prime RT-qPCR Mix | 快速靈敏的轉錄組基因定量檢測 |
| P9013 |
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| R1021 | TRAzol | 高效提取高質(zhì)量RNA |
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